بخش مهندسی بیوسیستم به واسطه بهره‌مندی از امکانات آموزشی و پژوهشی مناسب، جایگاه ویژه‌ای در سطح کشور دارد. آزمایشگاه­‌ها و کارگاه­‌های مختلف شامل آزمایشگاه مقاومت مصالح، آزمایشگاه موتورهای احتراقی، آزمایشگاه پمپ و نیز کارگاه اتومکانیک، کارگاه مکانیک تراکتور، کارگاه ماشین­ ابزار، کارگاه نجاری، کارگاه برق، کارگاه جوشکاری به همراه کارگاه تحصیلات تکمیلی و کارگاه‌های ماشین­‌های کشاورزی امکان آموزش علمی دانشجویان و نیز اجرای پژوهش‌­های کاربردی و عملی را در سطوح بالا فراهم می­‌کنند. از جمله امکانات مهم موجود در بخش می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:

• انباره خاک (Soil bin)
• دستگاه آزمایش کشش و فشار چند منظوره (اینستران)
• دستگاه دینامومتر
• اتاقک نورپردازی آسمان ابری و تجهیزات تصویربرداری
• تجهیزات تعیین شدت صوت، ارتعاش، رطوبت، میدان مغناطیسی و ...
• خشک‌­کن ­های خورشیدی متعدد
• سه دستگاه تراکتور
• قطعات برش خورده مختلف
• اتاق کامپیوتر
• چهار کلاس و یک سالن